Ontwikkelingen in de moleculaire diagnostiek van TSC

Ontwikkelingen in de moleculaire diagnostiek van TSC

Dr. Mark Nellist, Medisch Genetica, Erasmus Medisch Centrum, Rotterdam

Met de identificatie van TSC1 en TSC2 20 jaar geleden werd moleculaire diagnostiek voor TSC mogelijk. Toch is het nog steeds niet altijd eenvoudig om (i) een pathogene mutatie te vinden bij patienten met TSC, en (ii) de betekenis van een gevonden verandering in TSC1 of TSC2 te voorspellen.

Ontwikkelingen in de technologie om DNA af te lezen en kennis van de functie van de TSC1 en TSC2 genproducten maken het mogelijk om steeds meer TSC1 en TSC2 mutaties te vinden en de betekenis van deze veranderingen vast te leggen.

Ik zal een overzicht geven van het gebruik van nieuwe DNA sequentie technologie om het identificeren van TSC1 en TSC2 mutaties te verbeteren, en van studies naar de effecten van specifieke veranderingen in TSC1 en TSC2 op de functie van het TSC eiwit complex.

Referenties relevante/recente publicaties:

Qin J, Wang Z, Hoogeveen-Westerveld M, Shen G, Gong W, Nellist M, Xu W (2016) Structural Basis of the Interaction between Tuberous Sclerosis Complex 1 (TSC1) and Tre2-Bub2-Cdc16 Domain Family Member 7 (TBC1D7). J Biol Chem. 2016 Feb 18. pii: jbc.M115.701870. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 6893383

Nellist M, Brouwer RW, Kockx CE, van Veghel-Plandsoen M, Withagen-Hermans C, Prins-Bakker L, Hoogeveen-Westerveld M, Mrsic A, van den Berg MM, Koopmans AE, de Wit MC, Jansen FE, Maat-Kievit AJ, van den Ouweland A, Halley D, de Klein A, van IJcken WF (2015) Targeted Next Generation Sequencing reveals previously unidentified TSC1 and TSC2 mutations. BMC Med Genet. 16:10. doi: 10.1186/s12881-015-0155-4.

Hoogeveen-Westerveld M, Wentink M, van den Heuvel D, Mozaffari M, Ekong R, Povey S, den Dunnen JT, Metcalfe K, Vallee S, Krueger S, Bergoffen J, Shashi V, Elmslie F, Kwiatkowski D, Sampson J, Vidales C, Dzarir J, Garcia-Planells J, Dies K, Maat-Kievit A, van den Ouweland A, Halley D, Nellist M. (2011) Functional assessment of variants in the TSC1 and TSC2 genes identified in individuals with tuberous sclerosis complex. Hum. Mutation 32 p424-435.